Cuộc đối đấu giữa HAGL và Thanh Hóa ở trận tứ kết thứ ba được dự báo là khó lường. Tuy danh tiếng hơn nhưng HAGL không được đánh giá cao hơn Thanh Hóa. Thực tế trên sân khi lối chơi chỉ dựa vào mỗi tiền đạo U20 Quốc gia Minh Tiến đã không giúp cho đội bóng trẻ phố Núi giành được chiến thắng trong 90 phút.
Trong trận này, Thanh Hóa tạo thế trận khá tốt, có những cơ hội ăn bàn về phía khung thành HAGL nhưng không tận dụng thành công, đành chấp nhận trận hòa với tỷ số 0-0 sau 90 phút chính thức. Tình thế buộc 2 đội phải bước vào loạt 11m để phân định thắng thua. Trên chấm phạt đền, HAGL đã gục ngã với tỷ số thua 2-4, qua đó đành đứng nhìn Thanh Hóa giành vé vào bán kết.
Ở trận tứ kết còn lại vào chiều 30/4, SLNA đã vượt qua Bình Phước với tỷ số 4-1 ở màn bùng nổ trong hiệp 2. Phút 17, Văn Quý khai thông thế bế tắc cho SLNA sau khi thực hiện thành công quả 11m. Dù vậy, Bình Phước bất ngờ có bàn thắng san bằng tỷ số ở phút 40 sau pha dứt điểm trong thế trống trải của Tuấn Sang.
Trong hiệp 2, SLNA chứng tỏ sức mạnh vượt trội khi có thêm 3 bàn thắng vào lưới đối thủ. Các pha lập công của đội bóng trẻ xứ Nghệ do công của Quang Vinh (65’, 75’) và bàn đá phản của hậu vệ Bình Phước.
Sau vòng tứ kết, VCK U19 Quốc gia 2023 đã xác định được 2 trận bán kết của giải, diễn ra vào ngày 2/5. Trận bán kết 1 của giải là cuộc đối đầu giữa Hà Nội gặp SLNA (15h00). Trong khi đó, Thanh Hoá sẽ chạm trán Đà Nẵng trong trận bán kết 2 (17h30).