Sau buổi tập chiều tối 17/2, một vài thành viên của U23 Việt Nam có biểu hiện sốt. Để chủ động trong việc phối hợp với ban tổ chức trong công tác phòng chống dịch bệnh do Covid-19 gây ra một nghi phát hiện ca nghi nhiễm, đội ngũ y tế của U23 Việt Nam tiến hành xét nghiệm nhanh bằng bộ kit test được LĐBĐ Việt Nam cung cấp khi còn ở Việt Nam.
Kết quả, có 4 cầu thủ và một trợ lý cho kết quả nghi ngờ dương tính với Covid-19. Ngay sau khi có kết quả này, các bác sỹ của đội đã lập tức tách phòng các cầu thủ bị nghi ngờ nhiễm ở phòng riêng như khuyến cáo của bộ phần y yế BTC giải, đồng thời, báo cáo lên BTC để thực hiện các bước tiếp theo quy định. Trưởng đoàn Lưu Quang Điện Biên cũng đã báo cáo về lãnh đạo LĐBĐ Việt Nam để có những sự chỉ đạo cụ thể. Lãnh đạo LĐBĐ Việt Nam cũng đã động viên với các thành viên trong đội.
Về phần mình, U23 Việt Nam cũng đã có cuộc họp để giải quyết tình hình. Các thành viên của đội bình tĩnh xử lý tình huống phát sinh theo khuyến cáo của BTC giải cũng như kinh nghiệm điều trị Covid-19 đã được các bác sỹ thực hiện trong thời gian qua.
Trước đó khi đặt chân đến thủ đô Phnom Penh vào tối 11/2, các thành viên của đội đã được xét nghiệm nhanh cũng như PCR và cho kết quả âm tính. Sáng 15/2, đội ngũ y tế của U23 Việt Nam cũng đã chủ động tiến hành xét nghiệm nhanh và tất cả đều cho kết quả âm tính.