Thời gian bốc thăm môn bóng đá SEA Games 2021 đã được ấn định vào ngày 6/4 với các khung giờ từ 10h15 đến 10h50. Theo đó, môn futsal nữ sẽ bốc thăm vào lúc 10h15. Môn futsal nam bốc thăm vào lúc 10h25. Sau đó 10 phút, môn bóng đá nữ sẽ tiến hành bốc thăm chia bảng. Và vào lúc 10h50, môn bóng đá nam sẽ được tiến hành bốc thăm. HLV Park Hang Seo và HLV Mai Đức Chung sẽ có mặt ở buổi bốc thăm.
Liên quan đến bốc thăm chia bảng môn bóng đá nam, U23 Việt Nam và U23 Thái Lan được xếp hạng hạt giống số 1. Nhóm 2 gồm: Indonesia – Malaysia. Nhóm 3 có Myanmar – Campuchia. Nhóm 4 gồm Philippines – Singapore và nhóm 5: Lào – Timor Leste. Vòng bảng sẽ khởi tranh từ ngày 6-16/5. Trong đó, bảng A của U23 Việt Nam sẽ thi đấu vào các ngày 6, 8, 10, 13 và 15/5 trên sân Việt Trì (Phú Thọ) và bảng B của Thái Lan tranh vào các ngày 7, 9, 11, 14, 16/5 trên sân Thiên Trường (Nam Định).
Một trận bán kết sẽ diễn ra ở sân Việt Trì (Phú Thọ), trận bán kết còn lại đá ở sân Thiên Trường (Nam Định) đều trong ngày 19/5. Trận chung kết và tranh hạng ba sẽ diễn ra ngày 22/5 trên sân Mỹ Đình. Các trận sẽ thi đấu theo khung giờ 16h00 (trận 1) và 19h00 (trận 2).
Về phía đội tuyển nữ Việt Nam, nhóm hạt giống số 1 được xác định là đương kim vô địch SEA Games – tuyển nữ Việt Nam và Thái Lan. Nhóm hạt giống số 2 là Myanmar – Philippines. Các đội bóng còn lại gồm Campuchia, Indonesia, Lào và Singapore vào nhóm 3.
Môn bóng đá nữ sẽ thi đấu bảng A (bảng có ĐT nữ Việt Nam) vào các ngày 9, 11 và 14/5 trên sân Cẩm Phả. Trong khi bảng B sẽ thi đấu vào các ngày 10, 13 và 15/5. Trận bán kết sẽ diễn ra vào ngày 18/5. Các trận chung kết, tranh hạng ba đều diễn ra vào ngày 21/5 trên sân Cẩm Phả. Giờ thi đấu cũng là 16h00 (trận 1) và 19h00 (trận 2).
