Nhằm tạo điều kiện cho các đội thi đấu cọ xát ít nhất 2 trận để hướng đến SEA Games 31, AFF quyết định trận đấu giữa hai đội ở bảng B là U23 Malaysia và U23 Lào sẽ đá theo thể thức lượt đi – về. Nếu hòa sau 2 trận, hai đội sẽ bước vào 2 hiệp phụ để xác định vị trí nhất bảng. Nếu tiếp tục hòa, thứ hạng sẽ được xác định bằng loạt sút 11m. Đội nhất sẽ vào bán kết, nhưng đội nhì không được quyền xem xét để tranh vé nhì có thành tích tốt nhất. Vé nhì có thành tích tốt nhất để vào bán kết chỉ là cuộc đua của đội nhì giữa 2 bảng A và C.
Trước tình hình Covid-19 diễn biến phức tạp, AFF đã cho phép các đội bóng thay tối đa 10 cầu thủ nếu có người dương tính theo công thức 1-1. Đơn cử, nếu đội A có 5 cầu thủ dương tính với Covid-19 thì được quyền thay thế 5 cầu thủ tương ứng. Những cầu thủ chấn thương không được thay thế. Những cầu thủ đã thay thế không được đăng ký thi đấu trở lại. Đội được quyền thay thế có thể sử dụng bất cứ nguồn cầu thủ nào trong độ tuổi U23.
AFF cũng yêu cầu khi thay thế, đội bóng cần báo trước cho BTC ít nhất 12 giờ đồng hồ và có thể thay đổi vào bất cứ thời điểm nào của giải đấu.