Hợp đồng của Lee Nguyễn với CLB TP.HCM được ký kết tháng 12/2020, có giá trị 500.000 USD và thời hạn 10 tháng. Sau khi hợp đồng kết thúc, cả hai không đạt được thỏa thuận nên Lee Nguyễn nói lời chia tay đội bóng chủ sân Thống Nhất. Trong nửa mùa giải gắn bó với CLB TP.HCM, Lee Nguyễn để lại ấn tượng tốt với 5 bàn thắng trong 9 lần ra sân.
Sau khi chia tay CLB TP.HCM để về Mỹ nghỉ ngơi hồi tháng 8/2021, Lee Nguyễn tham gia huấn luyện CLB nữ Washington Spirit. Với vai trò trợ lý, Lee Nguyễn đã cùng đội nhà vô địch quốc gia chỉ sau 3 tháng làm việc. Hiện Lee Nguyễn đang theo học bằng HLV chuyên nghiệp tại Mỹ.
Còn nhớ ở buổi tập đầu tiên dưới triều đại của mình, HLV Trần Minh Chiến đã nói rằng: “Tôi chưa nói được gì về hợp đồng với Lee Nguyễn. Anh ấy rõ ràng là một cầu thủ đẳng cấp, đội bóng nào cũng cần, nhưng tôi sẽ xem xét lại. Tôi cần nói chuyện với Đỗ Văn Thuận, Hoàng Thịnh và đặc biệt là Trọng Long cầu thủ trẻ đang tập trung ở U23. Họ là các cầu thủ rất là tốt, cần trau giồi thêm và sẽ có thể đảm đương được. Tôi sẽ làm việc với BLĐ đội và tìm ra phương án tốt nhất”.