Ban đầu, giải hạng Nhất 2023/24 có 12 đội tham dự, nhưng sau đó CLB Bình Thuận đã có văn bản xin rút lui khỏi giải vì không có kính phí. Do đó, giải hạng Nhất mùa này chỉ còn 11 đội góp mặt. Cũng bởi vì chỉ còn 11 đội tham dự nên điều lệ của giải cũng có một số thay đổi cho phù hợp, đặc biệt là suất lên hạng và suất xuống hạng.
Theo điều lệ ban đầu, sẽ có 1,5 suất lên hạng V.League 2024/25 và 2 suất xuống chơi ở giải hạng Nhì 2024/25. Tuy nhiên, do Bình Thuận không tham dự, nên Ban chấp hành VFF đã thông qua ý kiến thống nhất giữ nguyên 1,5 suất thăng hạng V.League và điều chỉnh chỉ còn 1 suất rớt hạng xuống giải hạng Nhì, thay vì 2 như ban đầu.
Do có 1,5 suất thăng hạng V.League nên đội vô địch giải hạng Nhất sẽ chiếm suất lên hạng chính thức. 0,5 suất còn lại sẽ thuộc về đội thắng trận play-off giữa đội xếp thứ nhì của giải hạng Nhất đá với đội xếp thứ 13 của V.League. Đội thắng trận sẽ thi đấu ở V.League 2024/25, còn đội thua trận sẽ chơi ở giải hạng Nhất 2024/25. Trong khi đó, đội xếp thứ 11, tức đứng chót bảng giải hạng Nhất, sẽ xuống chơi ở hạng Nhì mùa giải 2024/25.