Khởi nghiệp ở Real Betis
Năm 1997, Joaquin Sanchez gia nhập học viện Real Betis. Đến mùa 2000/01, anh được đôn lên đội một và ngày 20/8/2000, đánh dấu trận đầu tiên của anh trong màu áo Betis trước Recreativo de Huelva tại Trofeo Colombino (giải giao hữu thường niên được Recreativo tổ chức, đã dừng lại ở năm 2016). Trận ra mắt chính thức đầu tiên của Joaquin diễn ra ở giải Hạng Nhì Segunda Division, khi họ làm khách trước SD Compostela vào ngày 3/9/2000 tại sân San Lazaro. Joaquin sớm thể hiện được tài năng khi ra sân 38 trận và ghi 3 bàn, giúp đội nhà thăng hạng lên La Liga ngay mùa đầu tiên cống hiến.
Trong 5 năm tiếp theo, Joaquin thi đấu tổng cộng hơn 200 trận trên mọi mặt trận và đóng góp 32 bàn thắng cùng 11 pha kiến tạo. Đặc biệt là mùa 2004/05, anh ra sân ở mọi trận tại La Liga, đóng góp 5 bàn thắng và thêm 3 pha lập công ở Copa del Rey để giúp đội nhà giành Cúp.
Đầu quân cho Valencia
Tháng 8/2006, Joaquin chuyển tới Valenica với giá chuyển nhượng 25 triệu euro, trở thành cầu thủ đắt giá nhất lịch sử CLB vào thời điểm đó. Mùa đầu, anh vẫn duy trì phong độ ở “chỗ làm mới” khi ghi bàn qua 35 trận, giúp “Bầy dơi” giành vé dự Champions League khi kết thúc ở vị trí thứ Tư tại La Liga. Mùa tiếp theo, Joaquin thành công nhất về mặt thống kê và danh hiệu: 7 bàn và 8 kiến tạo, giành Copa del Rey nhưng Valencia chỉ về đích thứ 10 ở La Liga.
Do David Villa chuyển tới Barcelona, Joaquin được tiếp quản áo số 7 của Valencia ở mùa 2010/11. Anh dẫn đầu danh sách ghi bàn sau vòng 1 khi lập cú đúp trong thắng lợi 3-1 trước Malaga. Ngày 12/2/2011, anh lập một cú đúp khác giúp đội nhà ngược dòng thắng Atletico Madrid. Valencia về thứ 3 chung cuộc năm đó, còn ở sân chơi Champions League, đội dừng lại ở vòng 1/8 trước Schalke.
Tuy nhiên, Valencia rơi vào cuộc khủng hoảng kinh tế trầm trọng và buộc phải bán những cầu thủ tốt nhất của mình, bao gồm cả Joaquin – cũng chuẩn bị bước vào năm cuối của hợp đồng – với giá 4,5 triệu euro cho Malaga.
Chuyến phiêu lưu cùng “gã giàu xổi” Malaga
Joaquin gắn bó với “đại gia mới nổi” Malaga trong 2 mùa bóng với 60 trận ra sân. Ở mùa thứ hai, anh tỏa sáng ở một số trận tại La Liga khi đội nhà xếp thứ 6 và đi đến tứ kết Copa del Rey, nơi gặp phải Barcelona hùng mạnh.
Nhưng điểm nhấn của Joaquin tại Malaga là các màn trình diễn tại Champions League khi họ xuất sắc đánh bại các đội bóng mạnh như AC Milan hay Porto. Chuyến phiêu lưu ở đấu trường danh giá nhất châu lục kết thúc ở vòng tứ kết khi họ để thua Dortmund trong trận cầu nhiều tranh cãi.
Lần đầu và trải nghiệm duy nhất ở nước ngoài ở Fiorentina
Joaquin rời La Liga cập bến Fiorentina ngày 12/6/2013 với giá 2 triệu euro và trải qua 2 năm khá thành công với 71 trận ra sân.
Mùa 2013/14, Fio là đệ tứ anh hào ở Serie A và là á quân Coppa Italia khi thua Napoli ở chung kết.
Mùa tiếp theo, Fio một lần nữa về thứ tư ở giải quốc nội, vào bán kết Coppa Italia và Europa League, nơi họ chỉ bị khuất phục bởi nhà vô địch của giải đấu là Sevilla.
Trở lại Betis vào năm 2015
Vào ngày 31/8/2015, chỉ ít giờ trước khi TTCN đóng cửa, Joaquin nhận lời trở lại với CLB mà anh khởi nghiệp. Năm 2017, anh sở hữu 2% cổ phần CLB.
Ngày 8/12/2019, Joaquin lập hat-trick sau 18 phút (cũng là lần đầu trong sự nghiệp thi đấu dài 2 thập kỷ), trong thắng lợi 3-2 trước Athletic Bilbao, trở thành cầu thủ già nhất ở La Liga làm được điều này (38 tuổi 140 ngày), phá kỷ lục cũ của Alfredo Di Stéfano tồn tại từ năm 1964.
Anh đi vào lịch sử của Betis vào ngày 21/5/2021 khi trở thành cầu thủ khoác áo CLB nhiều nhất, vượt qua Jose Ramon Esnaola với 461 trận.
Sau khi ghi bàn vào lưới Ludogorets Razgrad ở vòng bảng Europa League vào ngày 15/9/2002, anh trở thành cầu thủ già nhất ghi bàn của giải đấu: 41 tuổi 56 ngày.
Ở mùa giải 2021/22, với tư cách đội trưởng, Joaquin lần thứ 3 giương cao danh hiệu Copa del Rey, trong trận chung kết trước đội bóng cũ Valencia và anh là một trong những người thực hiện ở loạt đá luân lưu may rủi.
Đó là chiếc Cúp đầy cảm xúc cho Joaquin và Real Betis khi sau 17 năm vinh quang một lần nữa quay trở lại, như là cái kết viên mãn cho sự nghiệp dài 23 năm đáng nhớ của “ông nội” của La Liga.
Joaquin mời Cúp Copa del Rey đến dự lễ cưới
Sau khi giành Copa del Rey ở mùa 2004/05, Joaquin đã kết hôn với Susana Saborido vào ngày 8/7/2005. Joaquin thậm chí đã mang chiếc cúp vô địch tới lễ cưới của mình và coi đây là khách mời danh dự, cũng như toàn bộ đội hình Real Betis khi đó.