Sẽ có 12 đội tham dự vòng chung kết U19 quốc gia 2023 gồm Viettel, Hà Nội, Thanh Hóa (bảng A), Đà Nẵng, SLNA (bảng B), HAGL, Khánh Hòa (bảng C), Becamex Bình Dương, Bình Phước, chủ nhà Tây Ninh (bảng D), Đồng Tháp và An Giang (bảng E). Theo thông báo của Liên đoàn Bóng đá Việt Nam (VFF), 12 đội sẽ chia làm 3 bảng thi đấu vòng tròn một lượt tính điểm xếp hạng, chọn 6 đội nhất nhì 3 bảng và 2 đội thứ 3 có thành tích tốt nhất vào tứ kết thi đấu. Thời gian thi đấu vòng bảng từ 22-27/4; vòng tứ kết trong 2 ngày 29 và 30/4; vòng bán kết diễn ra ngày 2/5 và trận chung kết sẽ diễn ra ngày 4/5.
Về bốc thăm xếp lịch thi đấu vòng chung kết có 2 nguyên tắc chính, một là các đội cùng bảng ở vòng loại sẽ không nằm cùng bảng ở vòng chung kết, thứ hai đội Tây Ninh sẽ mang mã số A1 cùng 5 đội xếp nhất vòng loại sẽ bốc thăm vào 3 bảng sao cho mỗi bảng chỉ có tối đa 2 đội xếp nhất ở vòng loại. Thứ tự bốc thăm như sau, đội Tây Ninh chủ nhà mang mã số A1, bốc thăm cho đội Becamex Bình Dương vào bảng B hoặc C vì thầy trò HLV Võ Hồng Phúc cùng bảng với Tây Ninh ở vòng loại nên sẽ không nằm cùng bảng ở VCK đảm bảo theo nguyên tắc 1. Bốc thăm cho 4 đội đầu bảng vòng loại là Viettel, Đà Nẵng, HAGL và Đồng Tháp vào các bảng A, B, C đảm bảo nguyên tắc 2 (không quá 2 đội nhất bảng vòng loại cùng bảng ở VCK).
Tiếp đó xếp đội Bình Phước vào bảng B nếu Becamex Bình Dương ở bảng C hoặc ngược lại, đảm bảo nguyên tắc 1 không cùng bảng với Tây Ninh (3 đội cùng bảng vòng loại). Kế đến bốc thăm cho 2 đội Hà Nội và Thanh Hóa vào các bảng A, B, C đảm bảo nguyên tắc 1 không cùng bảng với Viettel. Cuối cùng sẽ là bốc thăm hoặc xếp lần lượt các đội SLNA, Khánh Hòa và An Giang vào 3 bảng đảm bảo nguyên tắc 1 không cùng bảng với các đội Đà Nẵng, HAGL và Đồng Tháp. Sau khi có danh sách cụ thể các đội vào 3 bảng sẽ bốc thăm mã số để sắp thứ tự thi đấu.
Theo kế hoạch, lễ họp báo, bốc thăm xếp lịch thi đấu và họp kỹ thuật sẽ diễn ra vào ngày 21/4/2023 tại Hội trường Khách sạn Sunrise Tây Ninh, số 81 Hoàng Lê Kha, (Phường 3, thành phố Tây Ninh, tỉnh Tây Ninh).
