Bắt đầu từ chiều 7/12, sau khi phát hiện có khoảng 7-8 cầu thủ dương tính với Covid-19, ban huấn luyện của CLB TP.HCM đã cho quân nghỉ tập trong vòng 2 tuần. Các trường hợp dương tính đều phải tiến hành cách ly tại chỗ dưới sự theo dõi của bộ phận y tế. Thời điểm này, do TP.HCM đang phải sống chung với dịch bệnh, nên những trường hợp lây nhiễm Covid-19 thực tế đã không còn quá nghiêm trọng như trước.
Bên cạnh đó, các cầu thủ của CLB TP.HCM đều đã tiêm phòng 2 mũi vắc xin, nên chỉ cần cách ly theo dõi bệnh tại chỗ và tuân thủ nghiêm túc biện pháp 5K của ngành y tế. Cũng do cầu thủ bị dính Covid-19, nên đội bóng buộc phải nghỉ tập luyện 2 tuần. Vì thế CLB TP.HCM sẽ không tham dự BTV Cup 2021 thêm như kế hoạch ban đầu, do không có quân thi đấu.
Theo kế hoạch, BTV Cup 2021 sẽ diễn ra tại Binh Dương từ ngày 17 đến 25/12. Ban đầu có 5 đội đăng ký tham dự gồm: B.Bình Dương, HL Hà Tĩnh, Nam Định, SHB Đà Nẵng và CLB TP.HCM, nhưng do CLB TP.HCM rút lui vào giờ chót nên khả năng đội thế chỗ sẽ là Sài Gòn FC. Các đội sẽ thi đấu vòng tròn 1 lượt tính điểm, xếp hạng.
Liên quan đến Covid-19, ngoài CLB TP.HCM, hiện một số thành viên của ban huấn luyện CLB B.Bình Dương cũng đang dương tính với dịch bệnh và hiện đang cách ly tại đại bản doanh của đội. Tuy nhiên, đội bóng vẫn tập luyện bình thường chuẩn bị cho việc tham dự BTV Cup 2021.