Có 30 đội tham dự vòng loại, được chia thành 6 bảng để thi đấu tại 6 địa điểm đăng cai. Theo kết quả chia bảng thì Công an Hà Nội, Hòa Bình, Nam Định, PVF, Viettel ở bảng A (Viettel đăng cai); Thanh Hóa, Hà Nội FC, Hưng Yên, Phú Thọ, SLNA ở bảng B (Trung tâm Thanh Trì đăng cai); Bình Định, HL Hà Tĩnh, Quảng Nam, SHB Đà Nẵng, Huế ở bảng C (Huế đăng cai); Bình Thuận, Đắk Lắk, Đồng Nai, Khánh Hòa, HAGL ở bảng D (HAGL đăng cai); B.Bình Dương, Long An, Tây Ninh, Tiền Giang, Bình Phước ở bảng E (Bình Phước đăng cai) và An Giang, Cần Thơ, Đồng Tháp, Vĩnh Long, TP.HCM ở bảng F (Trung tâm Thống Nhất – TP.HCM đăng cai).
Các đội sẽ thi đấu theo thể thức vòng tròn 2 lượt tính điểm, xếp hạng. 6 đội xếp thứ nhất và 5 đội đứng nhì có thành tích tốt nhất ở 6 bảng cùng chủ nhà (chưa xác định) sẽ vào VCK. Nếu chủ nhà của VCK nằm trong số 11 đội có thành tích tốt nhất ở vòng loại, thì đội xếp thứ nhì có thành tích tốt tiếp theo sẽ giành quyền dự VCK. Lượt đi của vòng loại U17 QG 2023 sẽ diễn ra từ ngày 9-19/2 và lượt về từ ngày 22/2-4/3. VCK diễn ra từ ngày 11-24/3. 12 đội dự VCK sẽ được chia thành 3 bảng để thi đấu. Hai đội nhất nhì của 3 bảng cùng 2 đội đứng thứ ba sau vòng bảng của VCK sẽ vào tứ kết.
